Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC192P0DO97 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms