Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CT47B1P0C2W7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
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