Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSP01100 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSP01100 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSP01100 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSP01100 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSP01100 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSP01100 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSP01100 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSP01100 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSP01100 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSP01100 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSP01100 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSP01100 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSP01100 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSP01100 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSP01100 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSP01100 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSP01100 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSP01100 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSP01100 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSP01100 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSP01100 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOSP01100 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSP01100 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSP01100 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSP01100 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSP01100 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSP01100 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSP01100 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSP01100 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSP01100 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSP01100 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSP01100 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSP01100 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSP01100 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSP01100 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSP01100 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSP01100 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSP01100 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSP01100 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSP01100 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSP01100 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSP01100 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSP01100 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSP01100 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOSP01100 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSP01100 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSP01100 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSP01100 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSP01100 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSP01100 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSP01100 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSP01100 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSP01100 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSP01100 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSP01100 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSP01100 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSP01100 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSP01100 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSP01100 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSP01100 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOSP01100 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSP01100 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSP01100 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSP01100 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSP01100 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSP01100 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSP01100 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSP01100 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSP01100 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSP01100 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSP01100 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSP01100 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSP01100 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSP01100 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSP01100 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSP01100 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOSP01100 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOSP01100 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOSP01100 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOSP01100 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOSP01100 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOSP01100 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSP01100 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSP01100 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSP01100 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSP01100 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSP01100 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSP01100 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSP01100 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSP01100 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSP01100 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSP01100 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSP01100 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSP01100 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSP01100 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSP01100 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSP01100 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSP01100 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOSP01100 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms