Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UFL1O94874 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UFL1O94874 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UFL1O94874 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UFL1O94874 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UFL1O94874 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UFL1O94874 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UFL1O94874 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UFL1O94874 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UFL1O94874 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UFL1O94874 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UFL1O94874 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UFL1O94874 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFL1O94874 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFL1O94874 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFL1O94874 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFL1O94874 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFL1O94874 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFL1O94874 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFL1O94874 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFL1O94874 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFL1O94874 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFL1O94874 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UFL1O94874 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFL1O94874 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFL1O94874 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFL1O94874 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFL1O94874 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFL1O94874 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFL1O94874 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFL1O94874 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFL1O94874 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UFL1O94874 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UFL1O94874 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UFL1O94874 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UFL1O94874 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UFL1O94874 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UFL1O94874 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UFL1O94874 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UFL1O94874 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UFL1O94874 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UFL1O94874 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UFL1O94874 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UFL1O94874 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UFL1O94874 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UFL1O94874 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFL1O94874 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFL1O94874 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UFL1O94874 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFL1O94874 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFL1O94874 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFL1O94874 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFL1O94874 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFL1O94874 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFL1O94874 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UFL1O94874 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFL1O94874 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UFL1O94874 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFL1O94874 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFL1O94874 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFL1O94874 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFL1O94874 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFL1O94874 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFL1O94874 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFL1O94874 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFL1O94874 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFL1O94874 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFL1O94874 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UFL1O94874 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UFL1O94874 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UFL1O94874 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UFL1O94874 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UFL1O94874 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UFL1O94874 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UFL1O94874 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UFL1O94874 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UFL1O94874 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UFL1O94874 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UFL1O94874 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms