Protein–RNA interactions for Protein: O75140

DEPDC5, GATOR complex protein DEPDC5, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC5O75140 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DEPDC5O75140 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
DEPDC5O75140 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DEPDC5O75140 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DEPDC5O75140 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DEPDC5O75140 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DEPDC5O75140 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DEPDC5O75140 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DEPDC5O75140 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DEPDC5O75140 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DEPDC5O75140 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DEPDC5O75140 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DEPDC5O75140 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms