Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSCO60682 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSCO60682 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSCO60682 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSCO60682 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSCO60682 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSCO60682 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSCO60682 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSCO60682 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MSCO60682 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSCO60682 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSCO60682 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSCO60682 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSCO60682 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSCO60682 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSCO60682 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSCO60682 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSCO60682 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSCO60682 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSCO60682 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSCO60682 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSCO60682 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSCO60682 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MSCO60682 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSCO60682 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSCO60682 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MSCO60682 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSCO60682 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSCO60682 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSCO60682 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSCO60682 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MSCO60682 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSCO60682 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSCO60682 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSCO60682 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSCO60682 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSCO60682 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MSCO60682 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MSCO60682 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MSCO60682 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MSCO60682 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MSCO60682 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSCO60682 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MSCO60682 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSCO60682 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MSCO60682 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSCO60682 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MSCO60682 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSCO60682 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSCO60682 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MSCO60682 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSCO60682 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSCO60682 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSCO60682 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSCO60682 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSCO60682 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSCO60682 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSCO60682 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSCO60682 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSCO60682 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSCO60682 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MSCO60682 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms