Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIN3BO60391 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIN3BO60391 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms