Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLIN1O60240 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLIN1O60240 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms