Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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