Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MEFVO15553 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MEFVO15553 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MEFVO15553 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MEFVO15553 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MEFVO15553 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MEFVO15553 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MEFVO15553 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MEFVO15553 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MEFVO15553 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MEFVO15553 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MEFVO15553 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MEFVO15553 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEFVO15553 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEFVO15553 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEFVO15553 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEFVO15553 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEFVO15553 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEFVO15553 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEFVO15553 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEFVO15553 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEFVO15553 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEFVO15553 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEFVO15553 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEFVO15553 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEFVO15553 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEFVO15553 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEFVO15553 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEFVO15553 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEFVO15553 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEFVO15553 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEFVO15553 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEFVO15553 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEFVO15553 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEFVO15553 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEFVO15553 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEFVO15553 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MEFVO15553 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEFVO15553 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MEFVO15553 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEFVO15553 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEFVO15553 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEFVO15553 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEFVO15553 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEFVO15553 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEFVO15553 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEFVO15553 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEFVO15553 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEFVO15553 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEFVO15553 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEFVO15553 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEFVO15553 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEFVO15553 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEFVO15553 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEFVO15553 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEFVO15553 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEFVO15553 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEFVO15553 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEFVO15553 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEFVO15553 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEFVO15553 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MEFVO15553 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MEFVO15553 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEFVO15553 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEFVO15553 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEFVO15553 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEFVO15553 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEFVO15553 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEFVO15553 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEFVO15553 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEFVO15553 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEFVO15553 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MEFVO15553 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEFVO15553 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEFVO15553 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEFVO15553 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEFVO15553 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEFVO15553 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEFVO15553 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEFVO15553 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEFVO15553 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEFVO15553 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEFVO15553 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEFVO15553 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEFVO15553 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEFVO15553 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEFVO15553 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEFVO15553 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEFVO15553 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEFVO15553 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEFVO15553 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEFVO15553 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEFVO15553 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEFVO15553 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEFVO15553 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEFVO15553 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEFVO15553 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEFVO15553 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEFVO15553 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEFVO15553 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms