Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms