Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms