Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms