Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COPS7AQ9UBW8 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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