Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAPPC6BQ86SZ2 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212 ms