Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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RTL8BQ17RB0 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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RTL8BQ17RB0 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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RTL8BQ17RB0 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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RTL8BQ17RB0 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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RTL8BQ17RB0 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RTL8BQ17RB0 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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