Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 FOLH1-213ENST00000533034 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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ECM1Q16610 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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ECM1Q16610 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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ECM1Q16610 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
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ECM1Q16610 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
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ECM1Q16610 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 ZNF555-201ENST00000334241 8557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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ECM1Q16610 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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ECM1Q16610 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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ECM1Q16610 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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ECM1Q16610 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 GRIK1-AS1-202ENST00000412579 818 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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ECM1Q16610 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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