Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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