Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 FTH1P20-201ENST00000434913 548 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RPL7L1P11-201ENST00000446092 721 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RN7SKP2-201ENST00000517003 319 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC010980.1-204ENST00000589724 585 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 Z99129.4-201ENST00000624649 2435 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 WDR19-207ENST00000506503 2513 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 GCNT3-209ENST00000560585 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MID1-212ENST00000616003 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 IGBP1-AS2-201ENST00000403371 513 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 FCHSD2-202ENST00000409263 932 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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