Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 EDA-213ENST00000616899 4643 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC107983.2-201ENST00000425211 4735 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LRRC37A17P-201ENST00000570311 4693 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 GBP4-201ENST00000355754 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC015813.3-201ENST00000584805 6113 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 OPCML-201ENST00000331898 6833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PTPRM-202ENST00000400053 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNF888-202ENST00000638862 4195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 VAPB-204ENST00000475243 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LRRC37A-202ENST00000393465 4997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SHPRH-211ENST00000629427 7338 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 IGSF1-206ENST00000370910 4406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AFDN-207ENST00000400822 7593 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SORL1-201ENST00000260197 10904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PLCG2-207ENST00000564138 8707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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