Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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R3HDM1Q15032 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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R3HDM1Q15032 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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R3HDM1Q15032 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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R3HDM1Q15032 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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R3HDM1Q15032 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
R3HDM1Q15032 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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