Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AP005328.2-201ENST00000606879 657 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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FOXE3Q13461 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CASC19-212ENST00000641153 1287 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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FOXE3Q13461 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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FOXE3Q13461 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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FOXE3Q13461 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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FOXE3Q13461 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 NT5C3A-201ENST00000242210 1670 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ZMYND11-216ENST00000602682 1687 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ACKR2-201ENST00000422265 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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