Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
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TCOF1Q13428 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
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TCOF1Q13428 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
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TCOF1Q13428 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC8.45□□□□□ -1.06
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TCOF1Q13428 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
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TCOF1Q13428 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
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TCOF1Q13428 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
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TCOF1Q13428 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC8.43□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
TCOF1Q13428 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
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