Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 EIF4EBP2P2-201ENST00000563883 333 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC024085.1-201ENST00000604299 432 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ELMO2P1-201ENST00000611569 473 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AP003068.4-201ENST00000623192 802 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 SNCA-206ENST00000420646 3127 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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MKRN3Q13064 SIRT5-205ENST00000606117 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ZNF736-202ENST00000423484 7119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 EEF1A1P22-201ENST00000559385 1380 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 CCDC190-203ENST00000367912 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 OR9M1P-202ENST00000641564 3163 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AL583836.1-201ENST00000464755 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 NOX4-210ENST00000527956 2379 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 CELF2-212ENST00000632728 3827 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 KCNMA1-248ENST00000638991 11990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ALDH6A1-202ENST00000553458 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ANKFY1-209ENST00000574367 5033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 MAPK10-202ENST00000359221 2668 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 PDZK1-202ENST00000417171 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 LINC02210-213ENST00000591271 9678 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 MEF2C-221ENST00000514015 2772 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 EVI2A-203ENST00000462804 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 NR1I3-202ENST00000367980 1403 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
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MKRN3Q13064 C2orf42-205ENST00000420306 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
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MKRN3Q13064 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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MKRN3Q13064 MSH4-201ENST00000263187 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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MKRN3Q13064 MAP3K19-205ENST00000392917 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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MKRN3Q13064 ABCA4-201ENST00000370225 7309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ZEB2-215ENST00000465070 2949 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ZKSCAN5-203ENST00000451158 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 PUM1-203ENST00000373742 3515 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 LINC00467-201ENST00000423222 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ERG-201ENST00000288319 4919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 DLG1-208ENST00000419354 3994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ST5-237ENST00000530991 3396 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ANKRD6-218ENST00000522441 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
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