Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC7□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC7□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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