Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ACADSBP45954 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms