Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVV-1B6SEH8 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms