Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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