Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 CCNT2-202ENST00000295238 4491 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
TIMMDC1Q9NPL8 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC016930.1-201ENST00000468766 2205 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 OR9K2-201ENST00000305377 1122 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LEMD1-202ENST00000367151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LEMD1-204ENST00000367153 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 IGKV3-15-201ENST00000390252 442 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LEMD1-206ENST00000391936 727 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC004160.2-201ENST00000425837 563 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MIATNB-204ENST00000437071 1006 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 FANK1-AS1-201ENST00000445458 428 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL356311.1-201ENST00000451697 258 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL508P-201ENST00000464472 303 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC098583.2-201ENST00000504151 372 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CCL26-201ENST00000005180 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 GZMB-205ENST00000526004 819 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC087280.1-201ENST00000530632 1003 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SRMP2-201ENST00000553832 916 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC009779.4-201ENST00000554248 611 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL132712.1-201ENST00000555967 582 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC015722.1-201ENST00000557499 385 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01582-201ENST00000560195 560 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC022898.1-202ENST00000560864 806 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL715P-201ENST00000606972 286 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL355480.4-201ENST00000626823 69 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.212-201ENST00000636778 248 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 KLF8-206ENST00000640927 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 OR9K2-204ENST00000641374 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 OAT-208ENST00000539214 1864 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 OSBPL6-202ENST00000315022 2999 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF345-202ENST00000420450 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 TCAM1P-205ENST00000478379 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 DTNA-209ENST00000556414 1626 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP76-201ENST00000364419 323 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PDHA1-202ENST00000379804 709 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 GNAI2P2-201ENST00000417003 916 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL355516.1-201ENST00000422082 746 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RPL19P21-201ENST00000424919 591 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL590729.1-201ENST00000427046 573 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC098828.1-201ENST00000436164 440 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC005840.2-201ENST00000447193 355 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms