Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RAB9BQ9NP90 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms