Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 HLTF-AS1-201ENST00000492461 415 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 KDM5DP1-201ENST00000622542 298 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP427-201ENST00000365323 119 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 LINC01687-203ENST00000420255 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 SLC8A1-AS1-207ENST00000444629 935 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms