Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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