Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NRF1Q16656 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms