Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 5_8S_rRNA.6-201ENST00000637374 152 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 LRP12-201ENST00000276654 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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CTF1Q16619 AC006013.1-201ENST00000424888 758 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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CTF1Q16619 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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CTF1Q16619 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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CTF1Q16619 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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CTF1Q16619 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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CTF1Q16619 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CTF1Q16619 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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