Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SS18Q15532 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SS18Q15532 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SS18Q15532 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SS18Q15532 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms