Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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