Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms