Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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HOXD10P28358 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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HOXD10P28358 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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HOXD10P28358 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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