Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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CLDN9O95484 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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CLDN9O95484 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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CLDN9O95484 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLDN9O95484 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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