Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 MTMR8-201ENST00000374852 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 VN1R6P-201ENST00000458417 907 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms