Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms