Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 OR1N2-201ENST00000373688 1103 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC103974.1-201ENST00000527285 874 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 LALBA-202ENST00000549817 1243 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 FBXO3-209ENST00000531080 1448 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
UBXN4Q92575 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
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