Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms