Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 OR4N2-203ENST00000557677 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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FXNQ16595 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 NDUFA3P1-201ENST00000588007 252 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC211486.5-201ENST00000616609 775 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL136298.2-201ENST00000556497 1570 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
FXNQ16595 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 PTMAP8-201ENST00000397729 342 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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FXNQ16595 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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FXNQ16595 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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FXNQ16595 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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FXNQ16595 AC122710.2-201ENST00000506093 596 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC097375.1-201ENST00000507949 488 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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FXNQ16595 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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FXNQ16595 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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FXNQ16595 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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FXNQ16595 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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