Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC005537.1-202ENST00000585996 666 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC090699.1-201ENST00000586264 321 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 TREM1-204ENST00000589614 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.124-201ENST00000610352 345 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 HIST1H2BM-201ENST00000621112 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 SLC9B1P3-201ENST00000452667 1334 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 IFT43-201ENST00000238628 816 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 Z93930.2-202ENST00000418292 208 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC091492.1-201ENST00000419844 272 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL122003.1-201ENST00000435206 784 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL591438.2-201ENST00000452635 691 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC126615.1-201ENST00000470084 630 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC006387.1-203ENST00000494849 342 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LEMD1-208ENST00000495594 637 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC012157.1-201ENST00000549725 501 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC138331.1-201ENST00000549993 376 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC233290.1-201ENST00000553021 1186 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 COX6CP11-201ENST00000555293 229 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC010931.3-201ENST00000561647 554 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC133569.1-201ENST00000564327 373 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC011840.3-201ENST00000579378 280 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC015802.4-202ENST00000591967 474 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC073539.3-201ENST00000601905 386 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL365259.1-201ENST00000606334 509 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ELMO2P1-202ENST00000614283 794 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.192-201ENST00000616260 286 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 MIR6776-201ENST00000616678 59 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC084879.1-201ENST00000636165 1201 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ZNF655-222ENST00000493277 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
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