Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 PPFIBP1-207ENST00000537927 5719 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 GPD2-202ENST00000409125 2661 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 BEND2-202ENST00000380033 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 UTY-205ENST00000382896 6661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 UTY-211ENST00000540140 6652 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 UTY-214ENST00000617789 6682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ANKFY1-209ENST00000574367 5033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 RHOBTB1-202ENST00000357917 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 PIK3AP1-203ENST00000371110 3151 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 GPR155-203ENST00000392552 6730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 DLG1-202ENST00000357674 4931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 GC-201ENST00000273951 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 C7-201ENST00000313164 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 HRH1-201ENST00000397056 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ZMAT3-201ENST00000311417 9406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 HIP1-204ENST00000434438 7066 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 RAPGEF5-212ENST00000620335 5506 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 NRP1-208ENST00000395995 5826 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ZNHIT6-202ENST00000431532 6080 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 CEACAM5-210ENST00000617332 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 NUDCD1-201ENST00000239690 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 PTCH1-205ENST00000418258 7815 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 NRP1-201ENST00000265371 5882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ZNF286A-221ENST00000593105 5222 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 WIPF2-201ENST00000323571 7474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MYH2-202ENST00000397183 6078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms