Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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CUL1Q13616 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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CUL1Q13616 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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