Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MTMR3Q13615 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MTMR3Q13615 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MTMR3Q13615 CCDC152-201ENST00000361970 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MTMR3Q13615 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MTMR3Q13615 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MTMR3Q13615 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MTMR3Q13615 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MTMR3Q13615 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MTMR3Q13615 PDZK1P1-201ENST00000401008 3498 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.16
MTMR3Q13615 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.16
MTMR3Q13615 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.16
MTMR3Q13615 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 UAP1-203ENST00000367925 2069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AL731892.1-201ENST00000437364 1192 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 NUTM2B-AS1-209ENST00000596088 366 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 GDNF-202ENST00000344622 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MTMR3Q13615 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
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