Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 KDM1B-203ENST00000546309 496 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 DNM1P33-201ENST00000565222 270 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC024614.1-201ENST00000577546 307 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC008770.1-209ENST00000591898 356 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL121985.2-201ENST00000621192 555 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 USP40-203ENST00000427112 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 UTP23-201ENST00000309822 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 PIWIL4-201ENST00000299001 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 DGKG-203ENST00000382164 3152 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LPAR1-202ENST00000374430 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ELOVL5-207ENST00000542638 2875 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC110926.1-201ENST00000412499 2825 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 SYNPR-204ENST00000460711 2383 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ACSL1-211ENST00000515030 3948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC011369.1-201ENST00000517408 2181 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ADAM2-205ENST00000521880 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CYP2C8-211ENST00000539050 2024 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 NUDT13-201ENST00000349051 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 DYNC2LI1-203ENST00000398823 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 GCSAML-211ENST00000623578 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LINC02026-201ENST00000397645 1615 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 GUCY1A3-202ENST00000393832 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AP001528.3-201ENST00000624364 3249 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 IL15-207ENST00000514653 1388 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LAMB4-202ENST00000388781 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ZNF781-201ENST00000358582 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 COX10-AS1-201ENST00000423323 3000 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RNA5SP389-201ENST00000362610 115 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RNA5SP226-201ENST00000362653 115 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RNA5SP79-201ENST00000365193 109 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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CLN3Q13286 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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CLN3Q13286 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 HMGA1P4-201ENST00000428643 334 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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CLN3Q13286 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 SYNJ2-IT1-201ENST00000442328 599 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL356311.1-201ENST00000451697 258 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RN7SL19P-201ENST00000462522 306 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 DKK2-204ENST00000513208 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL355102.4-201ENST00000553638 738 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL049780.1-201ENST00000554430 489 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC122685.1-202ENST00000556750 555 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC116903.1-201ENST00000557683 539 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 DRAIC-206ENST00000559029 309 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MT1L-202ENST00000566367 78 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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