Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SRSF5Q13243 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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